RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 LINC00479Q96M42 142 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 CD5LO43866 347 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 SP9P0CG40 484 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 PYYP10082 97 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 CAMPP49913 170 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 UTF1Q5T230 341 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 PATE2Q6UY27 113 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 RNF7Q9UBF6 113 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-202ENST00000542324 VWC2LB2RUY7 222 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 GLRXP35754 106 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 MPV17L2Q567V2 206 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 PRR27Q6MZM9 219 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 Q6ZVH6 145 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 GAFA1Q96PS6 74 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 CORTO00230 105 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 LTAP01374 205 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 P01737 135 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 IGKV1-16P04430 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 MLANAQ16655 118 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 GATD1Q8NB37 220 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 DPF1Q92782 380 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SARAFQ96BY9 339 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 HARBI1Q96MB7 349 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 LAMA1P25391 3075 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 hADV38S2A0JD32 116 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 M0R296 226 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 HAX1O00165 279 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 NUDT3O95989 172 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 PAX2Q02962 417 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 MSMPQ1L6U9 139 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 TRGV9Q99603 122 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 CST9LQ9H4G1 147 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 PROCRQ9UNN8 238 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 C22orf46C9J442 243 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 MOSP00540 346 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 LINC01545Q5VT33 79 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 TCF24Q7RTU0 167 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 NPIPB3Q92617 1050 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 DYSFO75923 2080 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 A0A1B0GW15 77 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 PGPA6NDG6 321 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 CHEK1O14757 476 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 CRYGCP07315 174 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 PLP1P60201 277 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 GNG5P63218 68 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SEC11AP67812 179 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 GTSF1Q8WW33 167 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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