RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 NGFP01138 241 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 FGF12P61328 243 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 TDRG1Q3Y452 100 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM42Q69YG0 159 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 MOB3BQ86TA1 216 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 C8orf46Q8TAG6 207 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 VSIRQ9H7M9 311 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 UTF1Q5T230 341 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 AHRRA9YTQ3 701 aa5.06□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 A0A087WV48 116 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 DPM2O94777 84 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-214ENST00000540109 UCN2Q96RP3 112 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 TTTY12Q9BZ98 90 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 CACNA1DQ01668 2161 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF32P17041 273 aa5.04□□□□□ -1.6
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