RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523237.1

CLN8-206, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, human

TSL 3

Gene CLN8, Length 835 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN8-206	ENST00000523237	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		12	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237		V9GYH0	126 aa		12	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	RND2	P52198	227 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	TNFRSF9	Q07011	255 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	LILRB2	Q8N423	598 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.99	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	IFNA10	P01566	189 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	CRYBB3	P26998	211 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	OR10J1	P30954	320 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF79	Q15937	498 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF124	Q15973	351 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	DTD1	Q8TEA8	209 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237		Q8WTZ3	238 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	RNF183	Q96D59	192 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237		U3KQ87	197 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	P2RY1	P47900	373 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	LYG2	Q86SG7	212 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	RBKS	Q9H477	322 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237		A0A0J9YWU9	116 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	MPTX1	A8MV57	137 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	JTB	O76095	146 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	VAMP1	P23763	118 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CLN8-206	ENST00000523237	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	DEFB131A	P59861	70 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	ACY3	Q96HD9	319 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	IFNA4	P05014	189 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	IL4	P05112	153 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	LEMD1	Q68G75	181 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	LRTM2	Q8N967	370 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237		U3KQE9	123 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	CXorf65	A6NEN9	183 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	HELT	A6NFD8	242 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237		K7EQG2	157 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	TOMM40	O96008	361 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	SLC25A6	P12236	298 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	INPP1	P49441	399 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	RYR2	Q92736	4967 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	LYST	Q99698	3801 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	PITX3	O75364	302 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	SFT2D2	O95562	160 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	STH	Q8IWL8	128 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	MED6	O75586	246 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	PMS2P11	Q13670	270 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	RARRES2	Q99969	163 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	NUPR2	A6NF83	97 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	ZFP92	A6NM28	416 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	PSG1	P11464	419 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	RAB11A	P62491	216 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	DHRS2	Q13268	280 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CLN8-206	ENST00000523237	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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