RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 TM2D2Q9BX73 214 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 HSPB6O14558 160 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 MT-ATP8P03928 68 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 OR5AL1P0C617 328 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 GPR12P47775 334 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 INSL3P51460 131 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 FXYD3Q14802 87 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 C20orf78Q9BR46 151 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PRD5 423 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PRF3 423 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PRM7 423 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 CXorf1O96002 111 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 PLP2Q04941 152 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF766Q5HY98 468 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZUT4 128 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PPV4 95 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 CENPWQ5EE01 88 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 ARPC1AQ92747 370 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PRE2 83 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 SCTP09683 121 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 AREGP15514 252 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 COL8A2P25067 703 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 CITED1Q99966 193 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 PKIBQ9C010 78 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 A0A087WX48 190 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 C3orf80F5H4A9 247 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 SMIM13P0DJ93 91 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 CFHR2P36980 270 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 DEFB124Q8NES8 71 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 OR51H1Q8NH63 302 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 XGP55808 180 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 ATP5J2P56134 94 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 SSX8Q7RTT4 187 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF488Q96MN9 340 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 PRO0461Q9UI25 63 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 A1L4Q6 167 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 IGLV2-8P01709 118 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 FGF12P61328 243 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF146Q15072 292 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 GUSBP1Q15486 140 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 MDP1Q86V88 176 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.91□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 IGHG4P01861 327 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 THBDP07204 575 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 CCL11P51671 97 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 SYT8Q8NBV8 401 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 GCM1Q9NP62 436 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 MGAQ8IWI9 3026 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 FHL3Q13643 280 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 Q6AWC8 147 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 PCSK4Q6UW60 755 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.9□□□□□ -1.3
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 E9PLD3 99 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 WISP2O76076 250 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CT45A6P0DMU7 189 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CT45A5P0DMU8 189 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CT45A7P0DMV0 189 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CA6P23280 308 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GCHFRP30047 84 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 MKXQ8IYA7 352 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms