RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.21□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF223E7ERA6 249 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 I3L2K1 104 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 FBP1P09467 338 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 OR5G3P0C626 314 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 NANPQ8TBE9 248 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF2Q99496 336 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 FUT9Q9Y231 359 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.2□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 LY6G6DO95868 133 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 NPBWR1P48145 328 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 BPIFB3P59826 476 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 BTN1A1Q13410 526 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM78BQ5VT40 261 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4X1Q8NH49 305 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 PFDN5Q99471 154 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CR1P17927 2039 aa8.19□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMB11A5LHX3 300 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 K7EIM0 57 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 COX7A2P2O60397 106 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 PAGE4O60829 102 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TGFAP01135 160 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 AVPP01185 164 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 FABP1P07148 127 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 GCHFRP30047 84 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CEBPGP53567 150 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TAS2R45P59539 299 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF90Q03938 601 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 PIFOQ8TCI5 191 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 SSX3Q99909 188 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.18□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM250H0YL14 139 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 M0R036 132 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP6V0E1O15342 81 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CLN5O75503 358 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLC1P0CG04 106 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CD81P60033 236 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM219Q86XT9 240 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4F5Q8NH21 305 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM68Q96MH6 324 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 OR4F4Q96R69 305 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 THYN1Q9P016 225 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.17□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 A6NDX4 124 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf94C9JXX5 98 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 H3BQ15 152 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 H3BUX3 64 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 M0QZK8 103 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 C8orf88P0DMB2 117 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2G2P60604 165 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ANK2Q01484 3957 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 ECSCRQ19T08 205 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 TIGITQ495A1 244 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 AWAT1Q58HT5 328 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 CST9LP1Q5W188 147 aa8.16□□□□□ -1.1
GTPBP1-211ENST00000487538 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms