RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXL17Q9UF56 701 aa6.12□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 GABARAPH6UMI1 98 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF688P0C7X2 276 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPPCP23582 126 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALDH3B2P48448 385 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAS2R19P59542 299 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPCS3P61009 180 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAFAH1B2P68402 229 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEF2DQ14814 521 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPCS2Q15005 226 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM16LQ309B1 348 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2orf83Q53S99 150 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR107Q5VW38 600 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 MZT2AQ6P582 158 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52E5Q8NH55 327 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 HRH4Q9H3N8 390 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAA60Q9H7X0 242 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR13Q9NZ81 148 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNG5Q9UF02 275 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RABAC1Q9UI14 185 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CELA1Q9UNI1 258 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR132Q9UNW8 380 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.11□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PS18 150 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RND2P52198 227 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM219AQ8IW50 185 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 STHQ8IWL8 128 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 AP3S1Q92572 193 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 METTL26Q96S19 204 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFFQ9GZY8 342 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.1□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTDSPLO15194 276 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 BUB3O43684 328 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 B3GALNT1O75752 331 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATG12O94817 140 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPP1P10451 314 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLA-DMBP28068 263 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 HTR2BP41595 481 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB1P60022 68 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHODHQ02127 395 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 NMSQ5H8A3 153 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZTC4 211 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.09□□□□□ -1.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOMM40O96008 361 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKAIN1P0CW23 69 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 MIFP14174 115 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10J1P30954 320 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCTAP57738 103 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHRS2Q13268 280 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB40CQ96S21 281 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOSTQ9BQB4 213 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 ENY2Q9NPA8 101 aa6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GVY2 172 aa6.07□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.07□□□□□ -1.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 HELTA6NFD8 242 aa6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms