RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNG5Q9UF02 275 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAH2Q9P225 4427 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 GABARAPH6UMI1 98 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLC1P0CG04 106 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 C4BPBP20851 252 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 HTR2BP41595 481 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RND2P52198 227 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 DHRS2Q13268 280 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 MEF2DQ14814 521 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM219AQ8IW50 185 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52E5Q8NH55 327 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR146Q96CH1 333 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 NAA60Q9H7X0 242 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 HELTA6NFD8 242 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLL5B9A064 214 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 DISC1C4P0D8 188 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 CTDSP2O14595 271 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RGS5O15539 181 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 NXPH3O95157 252 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 HLA-DMBP28068 263 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 OR10J1P30954 320 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 DHODHQ02127 395 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 C2orf83Q53S99 150 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 PSMG4Q5JS54 123 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 DCANP1Q8TF63 244 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 Q8WTZ3 238 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 U3KQE9 123 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.211e-6■■□□□ 12.5
SH3BP4-206ENST00000446904 SPP1P10451 314 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A4P12235 298 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 SPCS2Q15005 226 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 GLMPQ8WWB7 406 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 NPIPB3Q92617 1050 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 ACY3Q96HD9 319 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB40CQ96S21 281 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 HRH4Q9H3N8 390 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR13Q9NZ81 148 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.47□□□□□ -1.21
SH3BP4-206ENST00000446904 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 IL4P05112 153 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 MIFP14174 115 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 NPY1RP25929 384 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 TCTAP57738 103 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR141Q7Z602 305 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 APLNQ9ULZ1 77 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR132Q9UNW8 380 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 X6R8D5 127 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf94C9JXX5 98 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 AKAIN1P0CW23 69 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 RD3LP0DJH9 198 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 IL18Q14116 193 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 NMSQ5H8A3 153 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZTC4 211 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 PRRT1Q99946 306 aa7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SH3BP4-206ENST00000446904 XCL2Q9UBD3 114 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms