RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SP6Q3SY56 376 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 AARDQ4LEZ3 155 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 IGSF11Q5DX21 431 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SUMF2Q8NBJ7 301 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 OR52M1Q8NGK5 317 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 OR10J5Q8NHC4 309 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 TOMM40LQ969M1 308 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 MLXQ9UH92 298 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GVY2 172 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf52A6NGY3 159 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 M0QZK8 103 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SH2D1BO14796 132 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 FCN3O75636 299 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF6BO95407 300 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SCTP09683 121 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 OR8U9P0C7N5 309 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 CA6P23280 308 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6V0CP27449 155 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 NPBWR1P48145 328 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 GPM6AP51674 278 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 VAMP2P63027 116 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 CLINT1Q14677 625 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 DNLZQ5SXM8 178 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 TEX38Q6PEX7 206 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF826PQ6ZT77 177 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35E3Q7Z769 313 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 STX12Q86Y82 276 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 DYNAPQ8N1N2 210 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 OR11H1Q8NG94 326 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 OR10V1Q8NGI7 309 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 YPEL4Q96NS1 127 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ATP5SQ99766 215 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 RETNQ9HD89 108 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 IGSF23A1L1A6 192 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 FAM24AA6NFZ4 105 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 C12orf77C9JDV5 145 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 C9JQL5 133 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2CO00762 179 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SYNGR2O43760 224 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 BRI3O95415 125 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 IFNA5P01569 189 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 MBP02144 154 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINE2P07093 398 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 P0C879 139 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 FXYD4P59646 89 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 CD81P60033 236 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 HBG1P69891 147 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 HBG2P69892 147 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 HTD2P86397 168 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ACP7Q6ZNF0 438 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 DRAM1Q8N682 238 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC29Q8WV35 223 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 GPR146Q96CH1 333 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 RNF183Q96D59 192 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 OR4C12Q96R67 309 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 KCNIP1Q9NZI2 227 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF98A6NK75 572 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 WRBO00258 174 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 OVOL1O14753 267 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 RAB29O14966 203 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms