RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TIGITQ495A1 244 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 GPR141Q7Z602 305 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 SLC24A4Q8NFF2 622 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 STXBP6Q8NFX7 210 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 IL22RA2Q969J5 263 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 PRRT1Q99946 306 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 CACNG5Q9UF02 275 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 TCTAP57738 103 aa15.3■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 SPCS2Q15005 226 aa15.3■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM268Q5VZI3 342 aa15.3■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS54Q6PEW0 395 aa15.3■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 HRH4Q9H3N8 390 aa15.3■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 Q8NAQ8 132 aa15.29■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 Q8WTZ3 238 aa15.29■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 GPR146Q96CH1 333 aa15.29■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 HELTA6NFD8 242 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 IFNA4P05014 189 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 RND2P52198 227 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 NMSQ5H8A3 153 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ETFRF1Q6IPR1 90 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 NOXA1Q86UR1 476 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM170AQ8WVE7 144 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 GLMPQ8WWB7 406 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 BCL7BQ9BQE9 202 aa15.28■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.043e-6■■■□□ 16.3
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF688P0C7X2 276 aa15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 OR10J1P30954 320 aa15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 IL18Q14116 193 aa15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf54Q6UWD8 224 aa15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL17Q9UF56 701 aa15.27■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 CEBPZOSA8MTT3 80 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SULT1A3P0DMM9 295 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SULT1A4P0DMN0 295 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 MIFP14174 115 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 NPY1RP25929 384 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 OR51S1Q8NGJ8 323 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 C2CD4CQ8TF44 421 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf94C9JXX5 98 aa15.25■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 C4BPBP20851 252 aa15.25■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SCGB3A2Q96PL1 93 aa15.25■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.25■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 VPS13DQ5THJ4 4388 aa15.25■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB4AO15263 64 aa15.24■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 TOMM40O96008 361 aa15.24■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 IL4P05112 153 aa15.24■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 TMBIM6P55061 237 aa15.24■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS2Q13268 280 aa15.24■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 HSPB7Q9UBY9 170 aa15.24■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 U3KQ87 197 aa15.24■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 DNAH10Q8IVF4 4471 aa15.23■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0B4J2A0 478 aa15.23■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.23■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 KNCNA6PVL3 124 aa15.23■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 CCR6P51684 374 aa15.23■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa15.23■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 NPIPB3Q92617 1050 aa15.23■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.23■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 X6R8D5 127 aa15.23■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 BUB3O43684 328 aa15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 DEDDO75618 318 aa15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 NXPH3O95157 252 aa15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RBMY1CP0DJD4 496 aa15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SMCO1Q147U7 214 aa15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 ACTL10Q5JWF8 245 aa15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 NRN1Q9NPD7 142 aa15.22■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 DNAH6Q9C0G6 4158 aa15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A26D6RGX4 464 aa15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RD3LP0DJH9 198 aa15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 SRPXP78539 464 aa15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 PSMG4Q5JS54 123 aa15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 DTD1Q8TEA8 209 aa15.21■□□□□ 0.03
LIMS1-208ENST00000428064 RAB40CQ96S21 281 aa15.21■□□□□ 0.03
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