RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411292.1

SNORD71-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 71, humanhuman

BASIC

Gene SNORD71, Length 86 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD71-201ENST00000411292 C2orf50Q96LR7 162 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 AMELYQ99218 206 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 HIST1H2BNQ99877 126 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 HIST1H2BMQ99879 126 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CST9LQ9H4G1 147 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 ACER3Q9NUN7 267 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 UQCC1Q9NVA1 299 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CMTM6Q9NX76 183 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 USE1Q9NZ43 259 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 OR5AC2Q9NZP5 309 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 VPS29Q9UBQ0 182 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CKLFQ9UBR5 152 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 EPDR1Q9UM22 224 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 C15orf41Q9Y2V0 281 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 SNURFQ9Y675 71 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CACNA1HO95180 2353 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 F8P00451 2351 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 IGF2RP11717 2491 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 ADCY9O60503 1353 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 SPTBP11277 2137 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.08□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 PLB1Q6P1J6 1458 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 A0A0J9YY99 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 A0A1B0GV50 99 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 A0A1W2PPM0 123 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 PQLC2LA1A4F0 135 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 ERICH2A1L162 156 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 TMEM114B3SHH9 223 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 M0QZ92 97 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 M0R378 163 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CETN3O15182 167 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 NIPSNAP2O75323 286 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 HYPMO75409 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 OR2B3O76000 313 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 OR5F1O95221 314 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 IFNA10P01566 189 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 IGHV3-33P01772 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 TCRBP04435 133 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 IFNA16P05015 189 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CTXN2P0C2S0 81 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 OR4E1P0C645 316 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 OCM2P0CE71 109 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 FAM236CP0DP71 79 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 SPI1P17947 270 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 RPL5P46777 297 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CDK9P50750 372 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 BLVRAP53004 296 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 TCL1AP56279 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 PSME3P61289 254 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 HBA1P69905 142 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CCL7P80098 99 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 RHOGP84095 191 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 GRK1Q15835 563 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 KCNJ8Q15842 424 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 NDUFA5Q16718 116 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 MPV17LQ2QL34 196 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 Q6Q795 121 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 PATE2Q6UY27 113 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 Q6ZS49 121 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 MIR17HGQ75NE6 70 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 FAM9CQ8IZT9 166 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 OR52L1Q8NGH7 329 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 WFDC5Q8TCV5 224 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 SFT2D1Q8WV19 159 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 PSMF1Q92530 271 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 SLAMF6Q96DU3 332 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 CFAP53Q96M91 514 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 SERPINI1Q99574 410 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 SLC50A1Q9BRV3 221 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 NDEL1Q9GZM8 345 aa-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SNORD71-201ENST00000411292 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms