RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 ERG28Q9UKR5 140 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 H3BRM9 83 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 ASIPP42127 132 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 CD69Q07108 199 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 VOPP1Q96AW1 172 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 AKAP6Q13023 2319 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 UBE2L6O14933 153 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 PPBPP02775 128 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZRM9 215 aa8.13□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 MED12Q93074 2177 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 PCOLCEQ15113 449 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 SMPXQ9UHP9 88 aa8.13□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 K7EP34 96 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 COX6A1P12074 109 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 NPPCP23582 126 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.12□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.12□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 TIAF1O95411 115 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 C16orf97H3BN30 126 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 IGKV3-20P01619 116 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 NTF4P34130 210 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.11□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 PRCDQ00LT1 54 aa8.11□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 MORN2Q502X0 79 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 C21orf140B9A014 251 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 KLK10O43240 276 aa8.11□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 J3QW42 95 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 CEACAM4O75871 244 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A45Q8N413 288 aa8.1□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.1□□□□□ -1.11
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HERC3-202ENST00000402738 YPEL1O60688 119 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 CELA3AP09093 270 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 FAM106CPP0CH98 169 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 C2orf82Q6UX34 121 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 YPEL2Q96QA6 119 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 CELA3BP08861 270 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 CRYGSP22914 178 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 LAGE3Q14657 143 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-202ENST00000402738 ATXN8Q156A1 80 aa8.1□□□□□ -1.11
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