RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PITX3O75364 302 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 IFNA10P01566 189 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 CD7P09564 240 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A4P12235 298 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 NPY1RP25929 384 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 BMI1P35226 326 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 MFAP4P55083 255 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 HAGHQ16775 308 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 BSXQ3C1V8 233 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf83Q53S99 150 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 Q56UQ5 140 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SPINK9Q5DT21 86 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZRM9 215 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 MUC7Q8TAX7 377 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 MISP3Q96FF7 219 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA25Q9BR10 227 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RYR2Q92736 4967 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 OR11H12B2RN74 326 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf84H3BNL1 204 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 I3L2K1 104 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA4O00483 81 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SYNGR2O43760 224 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 MT-CO2P00403 227 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 IFNA4P05014 189 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 FABP1P07148 127 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf88P0DMB2 117 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 ADMP35318 185 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 OPRK1P41145 380 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R30P59541 319 aa5.75□□□□□ -1.49
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SGMS1-201ENST00000361543 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB125Q8N687 156 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RAB40CQ96S21 281 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RBKSQ9H477 322 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 PRR13Q9NZ81 148 aa5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.74□□□□□ -1.49
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SGMS1-201ENST00000361543 C5orf51A6NDU8 294 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 FAM25EA8MYX2 175 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RGS13O14921 159 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 SSNA1O43805 119 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 GNG7O60262 68 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-48P01763 117 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 CTSGP08311 255 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RGS21Q2M5E4 152 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 OR4X1Q8NH49 305 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 GINS3Q9BRX5 216 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RETNQ9HD89 108 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.74□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf62A8K5M9 175 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 L7N2F9 121 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 ADAP1O75689 374 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 YIF1AO95070 293 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 RLN2P04090 185 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 CD5P06127 495 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 PET100P0DJ07 73 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 LYL1P12980 280 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 S100A7P31151 101 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 VAMP2P63027 116 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 CASC10Q5T4H9 136 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 ASB13Q8WXK3 278 aa5.73□□□□□ -1.49
SGMS1-201ENST00000361543 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
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