RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SVILO95425 2214 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 PGPA6NDG6 321 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 VCYO14598 125 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 IFITM1P13164 125 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF880Q6PDB4 577 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM160Q9NX00 188 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 A0A096LPE4 126 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRD-201ENST00000355233 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRD-201ENST00000355233 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa4.1□□□□□ -1.75
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PTPRD-201ENST00000355233 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-201ENST00000355233 PRR32B1ATL7 298 aa4.1□□□□□ -1.75
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