RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-201ENST00000325599 IGHV1-8P0DP01 117 aa13.17□□□□□ -0.3
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SHQ1-201ENST00000325599 IER3P46695 156 aa13.17□□□□□ -0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SLC35B1P78383 322 aa13.17□□□□□ -0.3
SHQ1-201ENST00000325599 FOXC1Q12948 553 aa13.17□□□□□ -0.3
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM155Q4W5P6 130 aa13.17□□□□□ -0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CHODLQ9H9P2 273 aa13.17□□□□□ -0.3
SHQ1-201ENST00000325599 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.17□□□□□ -0.3
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