RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 REG1AP05451 166 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 C3orf79P0CE67 100 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 IAPPP10997 89 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP10-9P60411 292 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 RFESDQ8TAC1 157 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 DERL1Q9BUN8 251 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 MAST4O15021 2626 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 A0A1W2PS18 150 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 K7ERU9 68 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 FCN1O00602 326 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 PDE6DO43924 150 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 AMTP48728 403 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 UBALD1Q8TB05 177 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 GNG12Q9UBI6 72 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 NDUFB4O95168 129 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 SLC25A16P16260 332 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ZNF90Q03938 601 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 PRR27Q6MZM9 219 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 NIT1Q86X76 327 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 TNFRSF14Q92956 283 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 NF1P21359 2839 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 TAX1BP3O14907 124 aa8.26□□□□□ -1.09
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GINS3-201ENST00000318129 S100GP29377 79 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 LOXL3P58215 753 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 LMO4P61968 165 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 KCNS1Q96KK3 526 aa8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 IL36BQ9NZH7 164 aa8.26□□□□□ -1.09
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GINS3-201ENST00000318129 C17orf98A8MV24 154 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 FOXH1O75593 365 aa8.25□□□□□ -1.09
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GINS3-201ENST00000318129 DLX6P56179 175 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 LGALS4P56470 323 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ERASQ7Z444 233 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ATOH7Q8N100 152 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.25□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 S1PR2O95136 353 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 PMCHP20382 165 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 IER3P46695 156 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ATP5G3P48201 142 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ARF6P62330 175 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 PMCHL1Q16048 86 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 OR4A47Q6IF82 309 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ZNF596Q8TC21 504 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 RCHY1Q96PM5 261 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.24□□□□□ -1.09
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GINS3-201ENST00000318129 M0R1W7 72 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 CORTO00230 105 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 CA2P00918 260 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 CCL3L1P16619 93 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 BMI1P35226 326 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 LTC4SQ16873 150 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.23□□□□□ -1.09
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