RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 DEFA5Q01523 94 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 GAMTQ14353 236 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 CLINT1Q14677 625 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 TMEM147Q9BVK8 224 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 A0A0G2JLM5 398 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 TAAR5O14804 337 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 DFFBO76075 338 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ATP5G2Q06055 141 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 TMUB2Q71RG4 321 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 SLC35E1Q96K37 410 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ATP5SQ99766 215 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ARL6Q9H0F7 186 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 WFDC1Q9HC57 220 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 COL7A1Q02388 2944 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 IGHV3-48P01763 117 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 OR4X1Q8NH49 305 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 UBE2E2Q96LR5 201 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 GNB4Q9HAV0 340 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 C21orf62Q9NYP8 219 aa14.05□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 F8W735 103 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 BCL2L11O43521 198 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 MFAP4P55083 255 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 FHL3Q13643 280 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ACSM6Q6P461 480 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ATP6V0BQ99437 205 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 TXN2Q99757 166 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.04□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 I3L521 148 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 K7EIL1 84 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 RND2P52198 227 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ZNF266Q14584 549 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 NPIPB3Q92617 1050 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ACY3Q96HD9 319 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 S4R3C0 116 aa14.03□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 SMCO3A2RU48 225 aa14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 CLN5O75503 358 aa14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 NPBWR1P48145 328 aa14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 RUNX1Q01196 453 aa14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 AKR1C1Q04828 323 aa14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 THAP8Q8NA92 274 aa14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 OR11H1Q8NG94 326 aa14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 CCDC140Q96MF4 163 aa14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.01□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.01□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 C4BPBP20851 252 aa14.01□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 DPF1Q92782 380 aa14.01□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 OR5B12Q96R08 314 aa14.01□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 MPDU1O75352 247 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 JTBO76095 146 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 IFNA5P01569 189 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 IGHV3-23P01764 117 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 IGLC1P0CG04 106 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 OPCMLQ14982 345 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 FAM209BQ5JX69 171 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 TEPPQ6URK8 271 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 UBAC2Q8NBM4 344 aa14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa13.99□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 GNG7O60262 68 aa13.99□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 IGHV3-11P01762 117 aa13.99□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 Q56UQ5 140 aa13.99□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 BTNL8Q6UX41 500 aa13.99□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.99□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa13.98□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 CLEC3BP05452 202 aa13.98□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 OR10J1P30954 320 aa13.98□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 GPR183P32249 361 aa13.98□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 ZNF616Q08AN1 781 aa13.98□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 CLEC19AQ6UXS0 136 aa13.98□□□□□ -0.17
PTX4-201ENST00000293922 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms