RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF688P0C7X2 276 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 FBLN7Q53RD9 439 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SLC25A45Q8N413 288 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 C9JCJ5 164 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TNFRSF14Q92956 283 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 YPEL1O60688 119 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 YPEL2Q96QA6 119 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.7□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 TFF2Q03403 129 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 DTX2Q86UW9 622 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CD5P06127 495 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM86BQ8N661 226 aa6.7□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 CECR9P0C854 216 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 EGR4Q05215 589 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.7□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 TSKUQ8WUA8 353 aa6.7□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 GGTLC3B5MD39 225 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2BKO60814 126 aa6.7□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 IGKV1-33P01594 117 aa6.7□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2BDP58876 126 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2BCP62807 126 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LY6EQ16553 131 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 A8MWV9 139 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 GREM1O60565 184 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LINC01587Q99440 93 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 H3BUT2 72 aa6.69□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.69□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 GPHA2Q96T91 129 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 RNF125Q96EQ8 232 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 EPDR1Q9UM22 224 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 PLXNA2O75051 1894 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 RNF222A6NCQ9 220 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 EFEMP2O95967 443 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 BSPH1Q075Z2 132 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.69□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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LIMD1-201ENST00000273317 OVOL1O14753 267 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 GAGE13Q4V321 117 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 NDUFS8O00217 210 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 NPC2P61916 151 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 AGMATQ9BSE5 352 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 ATP5G3P48201 142 aa6.68□□□□□ -1.34
LIMD1-201ENST00000273317 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.68□□□□□ -1.34
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