RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
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SYP-201ENST00000263233 PRR27Q6MZM9 219 aa12.06□□□□□ -0.48
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SYP-201ENST00000263233 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
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SYP-201ENST00000263233 OR4C13Q8NGP0 309 aa12.01□□□□□ -0.49
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SYP-201ENST00000263233 BLNKQ8WV28 456 aa12.01□□□□□ -0.49
SYP-201ENST00000263233 CLEC5AQ9NY25 188 aa12.01□□□□□ -0.49
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