RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 LOXP28300 417 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
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POP4-201ENST00000221770 OR9G1Q8NH87 305 aa12.7□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa12.7□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 SMPXQ9UHP9 88 aa12.7□□□□□ -0.38
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POP4-201ENST00000221770 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.38
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POP4-201ENST00000221770 IGLC3P0DOY3 106 aa12.68□□□□□ -0.38
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POP4-201ENST00000221770 IGLV2-23P01705 113 aa12.68□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 C8orf88P0DMB2 117 aa12.68□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 ZNF503Q96F45 646 aa12.68□□□□□ -0.38
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POP4-201ENST00000221770 IGHV1-8P0DP01 117 aa12.67□□□□□ -0.38
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POP4-201ENST00000221770 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 IL36BQ9NZH7 164 aa12.67□□□□□ -0.38
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POP4-201ENST00000221770 NIT1Q86X76 327 aa12.66□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 TMEM133Q9H2Q1 129 aa12.66□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
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POP4-201ENST00000221770 SAP30O75446 220 aa12.65□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 TPPP2P59282 170 aa12.65□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 SAMD13Q5VXD3 122 aa12.65□□□□□ -0.38
POP4-201ENST00000221770 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
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POP4-201ENST00000221770 ENSAO43768 121 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
POP4-201ENST00000221770 SLC25A17O43808 307 aa12.65□□□□□ -0.39
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POP4-201ENST00000221770 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
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POP4-201ENST00000221770 TSPOP30536 169 aa12.63□□□□□ -0.39
POP4-201ENST00000221770 STXBP6Q8NFX7 210 aa12.63□□□□□ -0.39
POP4-201ENST00000221770 RITA1Q96K30 269 aa12.63□□□□□ -0.39
POP4-201ENST00000221770 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
POP4-201ENST00000221770 COX7A2P2O60397 106 aa12.63□□□□□ -0.39
POP4-201ENST00000221770 PRRX1P54821 245 aa12.63□□□□□ -0.39
POP4-201ENST00000221770 RPEL1Q2QD12 228 aa12.63□□□□□ -0.39
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