RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641523.1

CASC19-238, Transcript of cancer susceptibility 19, human

BASIC

Gene CASC19, Length 1,558 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-238	ENST00000641523	RAB25	P57735	213 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	GNMT	Q14749	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PSG5	Q15238	335 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	HMGN3	Q15651	99 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	RNF5	Q99942	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523		K7EIL1	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	SLC17A2	O00624	439 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	SLC31A2	O15432	143 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	NAPSA	O96009	420 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ZBTB25	P24278	435 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PSMB8	P28062	276 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	SERPINB10	P48595	397 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	OR2B8P	P59922	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	DHODH	Q02127	395 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	NPB	Q8NG41	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523		H0Y980	276 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	NDUFA3	O95167	84 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	OR4E1	P0C645	316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	CD37	P11049	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	RUNX1	Q01196	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PLGLA	Q15195	96 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523		Q8N402	240 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523		H7C2Y5	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PDCD5	O14737	125 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	APOA2	P02652	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ORM1	P02763	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	GADD45A	P24522	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	QRFP	P83859	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	UNC119	Q13432	240 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	INSL4	Q14641	139 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CASC19-238	ENST00000641523	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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