RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 CA1P00915 261 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 FAM168AQ92567 244 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 GNB1LQ9BYB4 327 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 OSTCQ9NRP0 149 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 CBLN4Q9NTU7 201 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM106BQ9NUM4 274 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 APOA2P02652 100 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 COMMD5Q9GZQ3 224 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 GNB4Q9HAV0 340 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TNFRSF1AP19438 455 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 DLX1P56177 255 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 OR5AU1Q8NGC0 362 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 RCHY1Q96PM5 261 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 C19orf24Q9BVV8 132 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 SAP30LQ9HAJ7 183 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 CSMD1Q96PZ7 3565 aa10.76□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 C16orf97H3BN30 126 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 REG1AP05451 166 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 Q0VG73 95 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 C11orf42Q8N5U0 333 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 Q8NA96 180 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TBX15Q96SF7 602 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 JKAMPQ9P055 326 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PKDREJQ9NTG1 2253 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PPIAL4EA0A075B759 164 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PPI3 338 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PPIAL4DF5H284 164 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 ISLRO14498 428 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 KLK10O43240 276 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PPIAL4FP0DN26 164 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 MFAP2P55001 183 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TAS2R45P59539 299 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF841Q6ZN19 808 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 Q8N976 141 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 NPIPB3Q92617 1050 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PPIAL4AQ9Y536 164 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1644Q3SXP7 199 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF329Q86UD4 541 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 CCL17Q92583 94 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 HSPB9Q9BQS6 159 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa10.75□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 C22orf46C9J442 243 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TEX43Q6ZNM6 134 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PDPNQ86YL7 162 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 OR4C13Q8NGP0 309 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 FXYD5Q96DB9 178 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PCNX1Q96RV3 2341 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF137PP52743 207 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TIGITQ495A1 244 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00311Q8N616 119 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 THAP8Q8NA92 274 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 OR10X1Q8NGY0 326 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa10.74□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PLAUP00749 431 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TPPP2P59282 170 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TCF15Q12870 199 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 BMPR1BO00238 502 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A17O43808 307 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 MGST1P10620 155 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 MYCNOSP40205 109 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 ERHP84090 104 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 OR4A5Q8NH83 315 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 MBD6Q96DN6 1003 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 C7orf69Q9H7B7 122 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TACC2O95359 2948 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 CNTFRP26992 372 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PAFAH1B2P68402 229 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 FAM71F2Q6NXP2 309 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 C8orf31Q8N9H6 132 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.73□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa10.72□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PN81 502 aa10.72□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms