RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 DTD1Q8TEA8 209 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4C12Q96R67 309 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP6V0BQ99437 205 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 RBKSQ9H477 322 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 C7orf66A4D0T2 115 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 LGALS9O00182 355 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 CSN3P07498 182 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 CTSGP08311 255 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ADMP35318 185 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 CD300CQ08708 224 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 C2orf83Q53S99 150 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 Q56UQ5 140 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 PEMTQ9UBM1 199 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV1-51P01701 117 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 EDN2P20800 178 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 OPRK1P41145 380 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 MFAP4P55083 255 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 MLANAQ16655 118 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 REC114Q7Z4M0 266 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 TXN2Q99757 166 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF320A2RRD8 509 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 A8MWP6 167 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 IFNA21P01568 189 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 NPY1RP25929 384 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10C1Q96KK4 312 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 U3KQ87 197 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM213A2RRL7 107 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 C2orf70A6NJV1 201 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 SYNGR2O43760 224 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 GNG7O60262 68 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 PRAF2O60831 178 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 IFNA10P01566 189 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 IL5P05113 134 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ID3Q02535 119 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL3L3-201ENST00000612839 K7EIL1 84 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFA4O00483 81 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 CCSO14618 274 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 MED6O75586 246 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 IAPPP10997 89 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 FOLR2P14207 255 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 CBLN1P23435 193 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 NPBWR1P48145 328 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 TM4SF20Q53R12 229 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 NOXA1Q86UR1 476 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4X1Q8NH49 305 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 PRR25Q96S07 402 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 SORL1Q92673 2214 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 A6NJY4 79 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 C15orf62A8K5M9 175 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 WRBO00258 174 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 CLN5O75503 358 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM50AO95807 157 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCL3L3-201ENST00000612839 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms