RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598086.5

FCHO1-224, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-224	ENST00000598086	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	SMLR1	H3BR10	107 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	CLEC3B	P05452	202 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	PET100	P0DJ07	73 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	CBLN1	P23435	193 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	FGL1	Q08830	312 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	NMS	Q5H8A3	153 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	NOXA1	Q86UR1	476 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	C2orf50	Q96LR7	162 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	MPTX1	A8MV57	137 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	LPAR6	P43657	344 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	ERVK-16	P61578	105 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF585B	Q52M93	769 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	FAM219A	Q8IW50	185 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	MLX	Q9UH92	298 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086		G3V3Q6	166 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	IGKV1-39	P01597	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	IGKV1D-39	P04432	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	GPR183	P32249	361 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	S100A10	P60903	97 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	TM4SF20	Q53R12	229 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	SEC22A	Q96IW7	307 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	OR10C1	Q96KK4	312 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	CXorf58	Q96LI9	332 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	LCE6A	A0A183	80 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086		A8MWP6	167 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	SCGB1D2	O95969	90 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	IGKV1-5	P01602	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC25A6	P12236	298 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	WT1-AS	Q06250	92 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	SMCO1	Q147U7	214 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	NSG2	Q9Y328	171 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086		A0A1B0GU03	582 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	MPC2	O95563	127 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	FGF2	P09038	288 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	OR13C7	P0DN81	318 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	G6PC	P35575	357 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FCHO1-224	ENST00000598086	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	KRAS	P01116	189 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086		P0C879	139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	MFAP2	P55001	183 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	OR1S1	Q8NH92	325 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	HINT2	Q9BX68	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	THYN1	Q9P016	225 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	ST8SIA3	O43173	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	TGOLN2	O43493	480 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC25A4	P12235	298 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	IL15RA	Q13261	267 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086	RAB32	Q13637	225 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FCHO1-224	ENST00000598086		Q5BKY6	102 aa		10.13	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms