RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	RABAC1	Q9UI14	185 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743		A0A0B4J293	547 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	GABARAP	O95166	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	IGKV1-5	P01602	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	UCP1	P25874	307 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	HTR2B	P41595	481 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	SPCS3	P61009	180 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	DHODH	Q02127	395 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	GPR107	Q5VW38	600 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	NOXA1	Q86UR1	476 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	STH	Q8IWL8	128 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	VSIR	Q9H7M9	311 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	CLN5	O75503	358 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	CD74	P04233	296 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM187	Q14656	261 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	SP6	Q3SY56	376 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	GPR141	Q7Z602	305 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	OR4X1	Q8NH49	305 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	ST8SIA2	Q92186	375 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	ABHD1	Q96SE0	405 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	DEFB131A	P59861	70 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	CTF1	Q16619	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743		Q8WTZ3	238 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	HELT	A6NFD8	242 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	CDS2	O95674	445 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743		P0C879	139 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	SLC25A4	P12235	298 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	PRRT1	Q99946	306 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-208	ENST00000579743	OR5AC1	P0C628	307 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	CRYBB3	P26998	211 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	P2RY1	P47900	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	IL18	Q14116	193 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF124	Q15973	351 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	FBXL17	Q9UF56	701 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743		A0A1B0GU03	582 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	SPP1	P10451	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	TCTA	P57738	103 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	LEMD1	Q68G75	181 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	RYR2	Q92736	4967 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	CTDSPL	O15194	276 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-208	ENST00000579743	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8

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