RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 NOTCH1P46531 2555 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TGP01266 2768 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ODAMA1E959 279 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CCRL2O00421 344 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 FGF16O43320 207 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TNFAIP8O95379 198 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CGB3P0DN86 165 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CGB7P0DN87 165 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 GZMHP20718 246 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CD24P25063 80 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 KCNJ3P48549 501 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RAB7AP51149 207 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 AESQ08117 197 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 MADCAM1Q13477 382 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HES5Q5TA89 166 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ELP2Q6IA86 826 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 SSX6Q7RTT6 188 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 APH1BQ8WW43 257 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RPEQ96AT9 228 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TSC22D3Q99576 134 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TBX5Q99593 518 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 GNG8Q9UK08 70 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 AP4S1Q9Y587 144 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 DAPL1A0PJW8 107 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 SERPINE3A8MV23 424 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1D-12P01611 117 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IGHG2P01859 326 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 HTR1AP08908 422 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 NFYBP25208 207 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 KIR3DL2P43630 455 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RND2P52198 227 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF138P52744 262 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 EBI3Q14213 229 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 KISS1Q15726 138 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 POU2AF1Q16633 256 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 Q6P435 159 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF695Q8IW36 515 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 PXT1Q8NFP0 134 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RDH12Q96NR8 316 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF649Q9BS31 505 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM212A6NML5 194 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 H3BSH0 61 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 J3QLW9 94 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 J3QRE1 110 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 M0R129 80 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SULT1B1O43704 296 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 MPZL2O60487 215 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 FADS2O95864 444 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 RAB4AP20338 218 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 CEACAM6P40199 344 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 INSL3P51460 131 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 AQP4P55087 323 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 HES1Q14469 280 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 KIR2DS1Q14954 304 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 CDK5R1Q15078 307 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 Q3ZCU0 254 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF691Q5VV52 312 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 GPR107Q5VW38 600 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 ASCL4Q6XD76 172 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 SYS1Q8N2H4 156 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 DRAM1Q8N682 238 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-208ENST00000560725 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms