RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558258.1

AC009558.2-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009558.2, Length 396 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009558.2-201ENST00000558258 M0R135 149 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SIRPB1O00241 398 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 GNGT2O14610 69 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 HAND1O96004 215 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 IFNA17P01571 189 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 GYPBP06028 91 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 TACSTD2P09758 323 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 LIMS3P0CW19 117 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 LIMS4P0CW20 117 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SLC25A16P16260 332 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 MPV17P39210 176 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 PPP1CBP62140 327 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 PSG7Q13046 419 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 OR2F1Q13607 317 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 RSU1Q15404 277 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 OR8B8Q15620 311 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ARL9Q6T311 187 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 Q6ZR03 302 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 Q6ZVH6 145 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 LRP11Q86VZ4 500 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SLC35F2Q8IXU6 374 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 CBR4Q8N4T8 237 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SLC7A6Q92536 515 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 MRAP2Q96G30 205 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF799Q96GE5 643 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 C16orf74Q96GX8 76 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 AMELYQ99218 206 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SIGMAR1Q99720 223 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ATP5SQ99766 215 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 NIPAL2Q9H841 368 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 RFNGQ9Y644 331 aa3.13□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 DNHD1Q96M86 4753 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 M0R129 80 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 GNG7O60262 68 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF861PO60384 105 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 IGHV1-46P01743 117 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ESDP10768 282 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF823P16415 610 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 CCL1P22362 96 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 CX3CR1P49238 355 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 RORCP51449 518 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 TAS2R43P59537 309 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 TAS2R31P59538 309 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 GNB2P62879 340 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 PPP3R1P63098 170 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF154Q13106 437 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 TAF9Q16594 264 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 C4orf26Q17RF5 130 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 TP53I3Q53FA7 332 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 DMRTC1Q5HYR2 192 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 OTPQ5XKR4 325 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 PVRIGQ6DKI7 326 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 LINC01551Q86U37 167 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SPTSSAQ969W0 71 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF649Q9BS31 505 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 MCUBQ9NWR8 336 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 FAM206AQ9NX38 181 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.12□□□□□ -1.91
AC009558.2-201ENST00000558258 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms