RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A18H0YCH9 400 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 WIPF1O43516 503 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 COL8A1P27658 744 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF56Q15929 161 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 STHQ8IWL8 128 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01560Q8TB33 94 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PRNDQ9UKY0 176 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 J3QLI3 93 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00271P0C7V0 271 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RCHY1Q96PM5 261 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SHROOM3Q8TF72 1996 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2L6O14933 153 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CBLN3Q6UW01 205 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 MYO10Q9HD67 2058 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM89A2RUT3 159 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RNF222A6NCQ9 220 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 THBDP07204 575 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SERF2P84101 59 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 UTF1Q5T230 341 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 STPG3Q8N7X2 389 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ZMAT4Q9H898 229 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF319Q9P2F9 582 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087X0K7 114 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 B4DSR2 109 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RNF138Q8WVD3 245 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 KCNE3Q9Y6H6 103 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 K7N7A8 449 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 UQCRQO14949 82 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 KISS1Q15726 138 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PSENENQ9NZ42 101 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRFP10586 1907 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ARID2Q68CP9 1835 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 WIPF3A6NGB9 483 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ATOX1O00244 68 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RBP4P02753 201 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CBLN1P23435 193 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf128Q5T292 105 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 IL36BQ9NZH7 164 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 WNT9BO14905 357 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 NAPSAO96009 420 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 IGHMP01871 453 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM157CP0CG43 387 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM157AC9JC47 383 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TM4SF5O14894 197 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CELA2AP08217 269 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf79P0CE67 100 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PYYP10082 97 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ID3Q02535 119 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PGPA6NDG6 321 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 REG1AP05451 166 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RIGQ13278 110 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZUT4 128 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 COX7A2P2O60397 106 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DYNLT3P51808 116 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D26Q86UD7 250 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM54Q969K7 222 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 TAX1BP3O14907 124 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IGHG3P01860 377 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 DLX1P56177 255 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 CST7O76096 145 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA7O95182 113 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms