RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SEC11CQ9BY50 192 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 B4DSR2 109 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MT-CO2P00403 227 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 NDPQ00604 133 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ICAM4Q14773 271 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 LY6EQ16553 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 PAGE4O60829 102 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 BCL2P10415 239 aa6.69□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 IGHV1-69P01742 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MAS1LP35410 378 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 Q5PR19 223 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 NPBQ8NG41 125 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OR1P1Q8NH06 330 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ITPR3Q14573 2671 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 FAM74A7A6NL05 159 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OOSP1A8MZH6 123 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 NDUFA3O95167 84 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OR5G3P0C626 314 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 LINC00869P0C866 280 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ORM2P19652 201 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ECSCRQ19T08 205 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ARPC1AQ92747 370 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.68□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SNAPINO95295 136 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 IGHV3-23P01764 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OR10J4P0C629 311 aa6.68□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 OR4F5Q8NH21 305 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OR4F4Q96R69 305 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SSX3Q99909 188 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.68□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OR7C2O60412 319 aa6.67□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 PSMB3P49720 205 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 DSCR9P59020 149 aa6.67□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 PRR20CP86479 221 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 PRR20DP86480 221 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 PRR20BP86481 221 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 PRR20AP86496 221 aa6.67□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 OR4X1Q8NH49 305 aa6.67□□□□□ -1.34
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CS-215ENST00000549143 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 C1RLQ9NZP8 487 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SLC25A16P16260 332 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 RHOBP62745 196 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 KHDC3LQ587J8 217 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-215ENST00000549143 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.67□□□□□ -1.34
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