RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OR10X1Q8NGY0 326 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 TNFRSF14Q92956 283 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OR8B2Q96RD0 313 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 GGACTQ9BVM4 153 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 SLC35B3Q9H1N7 401 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.31□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.31□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 ESPL1Q14674 2120 aa4.31□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 SPTBN2O15020 2390 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.3□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.3□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 OPN1MWP04001 364 aa4.3□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OR13C7P0DN81 318 aa4.3□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 NPY1RP25929 384 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 MC5RP33032 325 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 LGALS7P47929 136 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 PPT1P50897 306 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 PRRX1P54821 245 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 MFAP4P55083 255 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 RAB11AP62491 216 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 C2orf83Q53S99 150 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 KHDC3LQ587J8 217 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.3□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OR5B3Q8NH48 314 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OR4A5Q8NH83 315 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 CLCC1Q96S66 551 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 MGST2Q99735 147 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 PBDC1Q9BVG4 233 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 NPCDR1Q9BY65 106 aa4.3□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 FKBP11Q9NYL4 201 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.3□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 KPTNQ9Y664 436 aa4.3□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 ACACAQ13085 2346 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 SEC14L6B5MCN3 397 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 FNDC10F2Z333 226 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 H7C2Y5 167 aa4.29□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 MBP02144 154 aa4.29□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 LINC00869P0C866 280 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 COX7A1P24310 79 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 IL3RAP26951 378 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 CNTFRP26992 372 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OPRK1P41145 380 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 EFNA4P52798 201 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
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TRDN-205ENST00000546248 PVRIGQ6DKI7 326 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 MOB3BQ86TA1 216 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 PNKDQ8N490 385 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OR10W1Q8NGF6 305 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 OR1L8Q8NGR8 309 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 TIMD4Q96H15 378 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.29□□□□□ -1.72
TRDN-205ENST00000546248 HINT2Q9BX68 163 aa4.29□□□□□ -1.72
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