RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 CAMPP49913 170 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 Q56UQ5 140 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 CLEC7AQ9BXN2 247 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 PRORYQ9H606 182 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 ENY2Q9NPA8 101 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 C15orf61A6NNL5 157 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 ADH4P08319 380 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 PRR20EP86478 221 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 PRR20CP86479 221 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 PRR20DP86480 221 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 PRR20BP86481 221 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 PRR20AP86496 221 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 TNXAQ16473 311 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 TIGITQ495A1 244 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.59□□□□□ -0.55
PRAME-214ENST00000543184 MOGAT3Q86VF5 341 aa11.59□□□□□ -0.55
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PRAME-214ENST00000543184 CORTO00230 105 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 CCL25O15444 150 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 SPRY3O43610 288 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 OR2T6Q8NHC8 308 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 OR51B2Q9Y5P1 312 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 C9JCJ5 164 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 C11orf52Q96A22 123 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 IL19Q9UHD0 177 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 LRBAP50851 2863 aa11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 GAGE1Q13065 139 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 OR52E5Q8NH55 327 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 CALYQ9NYX4 217 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 J3QR06 171 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 MT-CO2P00403 227 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 APCSP02743 223 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 AREGP15514 252 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 HOXC12P31275 282 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 GNG5P63218 68 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 PRR7Q8TB68 274 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.57□□□□□ -0.56
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PRAME-214ENST00000543184 ZFP30Q9Y2G7 519 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 AKAP6Q13023 2319 aa11.57□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 H3BTX0 84 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 MFAP2P55001 183 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 RAB31Q13636 194 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 DDB2Q92466 427 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 E7EUB6 86 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 C9orf106Q8NAJ2 232 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 AMY1AP04745 511 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 REG1BP48304 166 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 PTTG1IPP53801 180 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TRAT1Q6PIZ9 186 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 OR4S2Q8NH73 311 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 C18orf32Q8TCD1 76 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 BORCS7Q96B45 105 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 OR2V2Q96R30 315 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.56□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 PRRX1P54821 245 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 C17orf58Q2M2W7 97 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 AARDQ4LEZ3 155 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TMEM14BQ9NUH8 114 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 JPT1Q9UK76 154 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 APELAP0DMC3 54 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 GFRALQ6UXV0 394 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 Q6ZT83 130 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 NEUROG1Q92886 237 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 DSCAML1Q8TD84 2053 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa11.54□□□□□ -0.56
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