RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516743.1

RNU6-307P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 307, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-307P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-307P-201ENST00000516743 EPDR1Q9UM22 224 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 HECW1Q76N89 1606 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 PIEZO1Q92508 2521 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 SIP14410 1827 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 LOC285556D6RIA3 1793 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 ZNF879B4DU55 563 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 HADHBP55084 474 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 AADACL4Q5VUY2 407 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 OR13D1Q8NGV5 346 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 TMEM14CQ9P0S9 112 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 TYMSP04818 313 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 MARCKSL1P49006 195 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 IFITM2Q01629 132 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 KHDC3LQ587J8 217 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 C1orf195Q5TG92 126 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 CST9Q5W186 159 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 DPPA3Q6W0C5 159 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 Q6ZS49 121 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 Q6ZS92 163 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 IQCF2Q8IXL9 164 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 Q8N402 240 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 OR13C4Q8NGS5 318 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 TAF1LQ8IZX4 1826 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 FAAHO00519 579 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 ZNF682O95780 498 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 RPL12P30050 165 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 SPINT3P49223 89 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 GRK1Q15835 563 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 OR8D4Q8NGM9 314 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 C4orf3Q8WVX3 66 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 GINS4Q9BRT9 223 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 FKBP14Q9NWM8 211 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 CMTM6Q9NX76 183 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 JPT1Q9UK76 154 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 C15orf41Q9Y2V0 281 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 OR2B3O76000 313 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 PET100P0DJ07 73 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 PSMB6P28072 239 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 CDC42P60953 191 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 COQ5Q5HYK3 327 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 Q8IYB0 196 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 OPTNQ96CV9 577 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 PSTPIP2Q9H939 334 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 TAS2R7Q9NYW3 318 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 ECM29Q5VYK3 1845 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 PQLC2LA1A4F0 135 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 C5orf67F2Z3F1 127 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 OR2J2O76002 312 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 C8orf88P0DMB2 117 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 KDELR1P24390 212 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 NAA20P61599 178 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 HBA1P69905 142 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 FAM74A1Q5RGS3 127 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 SLC51BQ86UW2 128 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 MCFD2Q8NI22 146 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 LINC00052Q96N35 136 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 DCSTAMPQ9H295 470 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 UBAP1Q9NZ09 502 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 V9GYY5 206 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 MYH7BA7E2Y1 1941 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-307P-201ENST00000516743 CECR2Q9BXF3 1484 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 KNTC1P50748 2209 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 BCL9O00512 1426 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 YKT6O15498 198 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 HIST3H2BBQ8N257 126 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 DNAJC9Q8WXX5 260 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 OR51V1Q9H2C8 321 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 FBXL12Q9NXK8 326 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 HECW2Q9P2P5 1572 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 FLNCQ14315 2725 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 FREM3P0C091 2139 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 MYH10P35580 1976 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 UNC79Q9P2D8 2635 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 SMIM9A6NGZ8 99 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 CXCR6O00574 342 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-307P-201ENST00000516743 PROSCO94903 275 aa-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms