RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-215	ENST00000514625	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	NUDT15	Q9NV35	164 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	NDUFA4	O00483	81 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	PITX3	O75364	302 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	SCGB2A1	O75556	95 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	CTSG	P08311	255 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	ADM	P35318	185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	MARC2	Q969Z3	335 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	ADAP1	O75689	374 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	CBLN1	P23435	193 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-215	ENST00000514625	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	YIF1A	O95070	293 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	SLC25A4	P12235	298 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	DEFA1	P59665	94 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	DEFA3	P59666	94 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625		K7EMT4	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	SYNGR2	O43760	224 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	CLN5	O75503	358 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	TMEM50A	O95807	157 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	IFNA4	P05014	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	RAB11A	P62491	216 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	MLANA	Q16655	118 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	SORL1	Q92673	2214 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	WRB	O00258	174 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	IAPP	P10997	89 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	EDN2	P20800	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	IFITM3	Q01628	133 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	GUCA2B	Q16661	112 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	MLX	Q9UH92	298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	MPTX1	A8MV57	137 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	RND2	P52198	227 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	ID3	Q02535	119 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	CD69	Q07108	199 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-215	ENST00000514625	IL5	P05113	134 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	ACY3	Q96HD9	319 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-215	ENST00000514625	OR10J1	P30954	320 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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