RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513398.1

ACTN3-203, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN3, Length 2,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-203ENST00000513398 BMPR1BO00238 502 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 NDUFB8O95169 186 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 CA7P43166 264 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 FAM201AQ5SY85 155 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 IL19Q9UHD0 177 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 AMY1AP04745 511 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 OR10J4P0C629 311 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 OSTCQ9NRP0 149 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 DPRXA6NFQ7 191 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 MMP23AO75900 390 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 PLAUP00749 431 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 IGLV1-44P01699 117 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 CD40P25942 277 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 COX19Q49B96 90 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 NIT1Q86X76 327 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 ATOH7Q8N100 152 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 HINT2Q9BX68 163 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 GCM1Q9NP62 436 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 C20orf202A1L168 122 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 PRRX1P54821 245 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 ENY2Q9NPA8 101 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 CA2P00918 260 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 HLA-DQA1P01909 254 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 MORN2Q502X0 79 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 PRR20EP86478 221 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 PRR20CP86479 221 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 PRR20DP86480 221 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 PRR20BP86481 221 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 PRR20AP86496 221 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 CD177Q8N6Q3 437 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 BORCS7Q96B45 105 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 OR7C2O60412 319 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 POLQO75417 2590 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 C15orf61A6NNL5 157 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 TSKUQ8WUA8 353 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 NABP2Q9BQ15 211 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 APCSP02743 223 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 LINC00869P0C866 280 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 PTTG1IPP53801 180 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 JPT1Q9UK76 154 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 LRRC29Q8WV35 223 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 ISLRO14498 428 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 PRDX2P32119 198 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 CCL8P80075 99 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 LCN12Q6JVE5 192 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 OR4S2Q8NH73 311 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 GGTLC3B5MD39 225 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 MYOD1P15172 320 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 MAJINQ3KP22 176 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF134P52741 427 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 STUMQ69YW2 141 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 CORO2AQ92828 525 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 CCL25O15444 150 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 REG1AP05451 166 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 KIR2DS2P43631 304 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 Q6ZVH6 145 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF503Q96F45 646 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 IGLV2-8P01709 118 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 TSPOP30536 169 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 GNG10P50151 68 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 OR4A47Q6IF82 309 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTN3-203ENST00000513398 MOB3BQ86TA1 216 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms