RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.79□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.79□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.79□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 M0QZK8 103 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFS7O75251 213 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 OR10J4P0C629 311 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 ESDP10768 282 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 CDKN1AP38936 164 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 SPINK9Q5DT21 86 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 NAGKQ9UJ70 344 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF90Q03938 601 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 RPEL1Q2QD12 228 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 MIC13Q5XKP0 118 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00311Q8N616 119 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 STPG3Q8N7X2 389 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 OR5T1Q8NG75 326 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF714Q96N38 554 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 MS4A10Q96PG2 267 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
POLR1A-208ENST00000486964 RRHO14718 337 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 SCGB1D1O95968 90 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 RBP4P02753 201 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 CCL3L1P16619 93 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 ERVFC1-1P60608 527 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 PRR20EP86478 221 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 PRR20CP86479 221 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 PRR20DP86480 221 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 PRR20BP86481 221 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 PRR20AP86496 221 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 LTC4SQ16873 150 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 TIMD4Q96H15 378 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 PDZD2O15018 2839 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 TACC2O95359 2948 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GV90 55 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 M0R143 59 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 CRISP2P16562 243 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 ADMP35318 185 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 GNG4P50150 75 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 PRCDQ00LT1 54 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 Q0VG73 95 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 TIGITQ495A1 244 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 OR4A47Q6IF82 309 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 OR5B3Q8NH48 314 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 DERL1Q9BUN8 251 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 OSTCQ9NRP0 149 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 CA2P00918 260 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV4-39P01824 125 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 FOSL1P15407 271 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF137PP52743 207 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 LGALS4P56470 323 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00205P59089 165 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 PAX2Q02962 417 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 C2orf83Q53S99 150 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 RASL11AQ6T310 242 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 OCC1Q8TAD7 63 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 LEAP2Q969E1 77 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 OR8B2Q96RD0 313 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms