RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 MLXQ9UH92 298 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.29□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 A0A0G2JRQ6 117 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RNF222A6NCQ9 220 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 H0YJW9 148 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 LGALS9O00182 355 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 PROP1O75360 226 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV1-39P01597 117 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV1D-39P04432 117 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RPA2P15927 270 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 CBLN1P23435 193 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 S100GP29377 79 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00205P59089 165 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 S100A10P60903 97 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 MSMO1Q15800 293 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF585BQ52M93 769 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM177Q53S58 311 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 NMSQ5H8A3 153 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 FAM71F2Q6NXP2 309 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 Q6ZR54 194 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMUB2Q71RG4 321 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF546Q86UE3 836 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 STPG3Q8N7X2 389 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 OR1S1Q8NH92 325 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 THAP6Q8TBB0 222 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM68Q96MH6 324 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.28□□□□□ -1.56
CASQ1-203ENST00000481081 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM213A2RRL7 107 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00473A8K010 186 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 C16orf90A8MZG2 172 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf94C9JXX5 98 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 K7EPK0 472 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ITGB1BP1O14713 200 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 B3GALNT1O75752 331 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SCGB1D2O95969 90 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV1-5P01602 117 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SERPINE2P07093 398 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 S100A11P31949 105 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 LPAR6P43657 344 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 IL22RA2Q969J5 263 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 GPR146Q96CH1 333 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ARL6Q9H0F7 186 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RAB9BQ9NP90 201 aa5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 A0A0D9SG52 128 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 M0R1X1 148 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 NXPH3O95157 252 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SPDEFO95238 335 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV1-16P04430 117 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 CRYGBP07316 175 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 MC5RP33032 325 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 CATR1Q13166 79 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF345Q14585 488 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TEX261Q6UWH6 196 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 Q6ZRM9 215 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RARRES2Q99969 163 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 U3KQ87 197 aa5.26□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PPP5D1E7EU14 171 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms