RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	LGALS9	O00182	355 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CORT	O00230	105 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IFNA4	P05014	189 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	NPY1R	P25929	384 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	NPBWR1	P48145	328 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	MLANA	Q16655	118 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	LRTM2	Q8N967	370 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ENKUR	Q8TC29	256 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TXN2	Q99757	166 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM213	A2RRL7	107 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM25E	A8MYX2	175 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	WRB	O00258	174 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	MED6	O75586	246 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	UPK1B	O75841	260 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	SCGB1D2	O95969	90 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CTSG	P08311	255 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CBLN1	P23435	193 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ADM	P35318	185 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CD69	Q07108	199 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	AARD	Q4LEZ3	155 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	C2orf83	Q53S99	150 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	BTNL8	Q6UX41	500 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	NOXA1	Q86UR1	476 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970		A8MWP6	167 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	NDUFA4	O00483	81 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CCS	O14618	274 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	SCGB2A1	O75556	95 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	RND2	P52198	227 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ASAH1	Q13510	395 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ACY3	Q96HD9	319 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ASCL2	Q99929	193 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	MLX	Q9UH92	298 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	COL7A1	Q02388	2944 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	MPTX1	A8MV57	137 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970		H3BP45	60 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	SYNGR2	O43760	224 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	PITX3	O75364	302 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM50A	O95807	157 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC25A6	P12236	298 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	CD81	P60033	236 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	RAB11A	P62491	216 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	BSX	Q3C1V8	233 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TIGIT	Q495A1	244 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	MARC2	Q969Z3	335 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970		U3KQ87	197 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	C5orf51	A6NDU8	294 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	SSSCA1	O60232	199 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	CLN5	O75503	358 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC25A4	P12235	298 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	OR10J1	P30954	320 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	DEFA1	P59665	94 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	DEFA3	P59666	94 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PSMD4-208	ENST00000462970	IFITM3	Q01628	133 aa		7.26	□□□□□ -1.25

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