RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 SULT1A3P0DMM9 295 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 SULT1A4P0DMN0 295 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 OPRK1P41145 380 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 CCR6P51684 374 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 BSXQ3C1V8 233 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC16A13Q7RTY0 426 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 OR52E5Q8NH55 327 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 SMPXQ9UHP9 88 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAV25A0A0B4J276 109 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 K7EMT4 169 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM50AO95807 157 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 NPBWR1P48145 328 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD55Q3KP44 614 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 NMSQ5H8A3 153 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 TOMM20LQ6UXN7 152 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM170AQ8WVE7 144 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 CITED4Q96RK1 184 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM110AQ9BQ89 295 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 C15orf62A8K5M9 175 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 VAMP1P23763 118 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 LGI3Q8N145 548 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM116Q8NCL8 245 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF2Q99496 336 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A0B4J2A0 478 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1B0GU03 582 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 CHEK1O14757 476 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 APOHP02749 345 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 OR10C1Q96KK4 312 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA25Q9BR10 227 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 RBKSQ9H477 322 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 SHPKQ9UHJ6 478 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP5-208ENST00000459627 ANXA3P12429 323 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 HTR2BP41595 481 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 TFPI2P48307 235 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 INPP1P49441 399 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R1AQ13522 171 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 SMCO1Q147U7 214 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 TIGITQ495A1 244 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC24A4Q8NFF2 622 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFAND3Q9H8U3 227 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 CORTO00230 105 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 TSPAN4O14817 238 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 TNFRSF9Q07011 255 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 C2orf83Q53S99 150 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM128Q5BJH2 165 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIQKQ629K1 86 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF600Q6ZNG1 722 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 LILRB2Q8N423 598 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 OR1S1Q8NH92 325 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 HIPK2Q9H2X6 1198 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 FLVCR2Q9UPI3 526 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 CLN5O75503 358 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 GBGT1Q8N5D6 347 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 OR4X1Q8NH49 305 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 ST8SIA2Q92186 375 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 SFT2D2O95562 160 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 NPY1RP25929 384 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 RND2P52198 227 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 SRPXP78539 464 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 CENPSQ8N2Z9 138 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 HSPB7Q9UBY9 170 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 IFNA10P01566 189 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 ODF3L2Q3SX64 289 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 PRSS54Q6PEW0 395 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 DTD1Q8TEA8 209 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV1-17P01599 117 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 HOXB5P09067 269 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 IAPPP10997 89 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF124Q15973 351 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 MUC7Q8TAX7 377 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 GINS3Q9BRX5 216 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 TCF24Q7RTU0 167 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 WFDC3Q8IUB2 231 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 DEDD2Q8WXF8 326 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 ACY3Q96HD9 319 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP5-208ENST00000459627 OR4C46A6NHA9 309 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 IL7P13232 177 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 BTCP35070 178 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM90A2PQ658T7 463 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFAND6Q6FIF0 208 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 APRG1Q8IVJ8 170 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 GGTLC1Q9BX51 225 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 EDA2RQ9HAV5 297 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 NDUFA13Q9P0J0 144 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP5-208ENST00000459627 PITX3O75364 302 aa17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms