RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 APOHP02749 345 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 OPRK1P41145 380 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 TMEM187Q14656 261 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 ZNF124Q15973 351 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 PVRIGQ6DKI7 326 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 TMEM116Q8NCL8 245 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 TRIM63Q969Q1 353 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 OR10C1Q96KK4 312 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 TXN2Q99757 166 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 GGTLC1Q9BX51 225 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 RABL2BQ9UNT1 228 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 V9GYH0 126 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GU03 582 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 B3GALNT1O75752 331 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 AKR1C4P17516 323 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 DHODHQ02127 395 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 ZNF79Q15937 498 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 BSXQ3C1V8 233 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 PYDC2Q56P42 97 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 FAM219AQ8IW50 185 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 ST8SIA2Q92186 375 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-209ENST00000439106 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 CEBPZOSA8MTT3 80 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 TMEM50AO95807 157 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 NPBWR1P48145 328 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 SPCS3P61009 180 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 AARDQ4LEZ3 155 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 APRG1Q8IVJ8 170 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 LILRB2Q8N423 598 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 OR4C46A6NHA9 309 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 CORTO00230 105 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 DEFB135Q30KP9 77 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 TIGITQ495A1 244 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 ZNF600Q6ZNG1 722 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 TMED4Q7Z7H5 227 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-209ENST00000439106 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10.25□□□□□ -0.77
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PRAME-209ENST00000439106 SULT1A3P0DMM9 295 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 SULT1A4P0DMN0 295 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A2PQ658T7 463 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 TCF24Q7RTU0 167 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 TOMM5Q8N4H5 51 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 SLC24A4Q8NFF2 622 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 OR52E5Q8NH55 327 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 GINS3Q9BRX5 216 aa10.25□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 DFFBO76075 338 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 S100A5P33763 92 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 HTR2BP41595 481 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 RND2P52198 227 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 C2orf83Q53S99 150 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 NMSQ5H8A3 153 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 CCDC190Q86UF4 302 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 OR4X1Q8NH49 305 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 IL22RA2Q969J5 263 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 VSIRQ9H7M9 311 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 MAP6D1Q9H9H5 199 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.24□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 ALMS1Q8TCU4 4167 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1-17P01599 117 aa10.23□□□□□ -0.77
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PRAME-209ENST00000439106 PRSS54Q6PEW0 395 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 FAM24BQ8N5W8 94 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 SCGB3A2Q96PL1 93 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 RBKSQ9H477 322 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 A0A0B4J2A0 478 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 IGLC1P0CG04 106 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 VAMP1P23763 118 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 NPY1RP25929 384 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 TNFRSF9Q07011 255 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 SMCO1Q147U7 214 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 LGI3Q8N145 548 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 SRRQ9GZT4 340 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 MS4A6AQ9H2W1 248 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-209ENST00000439106 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
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