RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 OR5B12Q96R08 314 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 IGSF23A1L1A6 192 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 HMSDA8MTL9 139 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 ELANEP08246 267 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 DEFA4P12838 97 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 RAB11AP62491 216 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 STX12Q86Y82 276 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 OR5T1Q8NG75 326 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 OR11H1Q8NG94 326 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 OR1P1Q8NH06 330 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 CYB5BO43169 146 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 IFNA4P05014 189 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 SULT1A1P50225 295 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 CFHR3Q02985 330 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 BAXQ07812 192 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 AQP10Q96PS8 301 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 MFFQ9GZY8 342 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 GNB4Q9HAV0 340 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 RNF222A6NCQ9 220 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 CORTO00230 105 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 CST7O76096 145 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 IGHG4P01861 327 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 PRH1P02810 166 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 10
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 MFAP2P55001 183 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 RNF152Q8N8N0 203 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 KLK15Q9H2R5 256 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 HSPB11Q9Y547 144 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-208ENST00000438888 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 H3BUA1 57 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 SOX15O60248 233 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 PSMB8P28062 276 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 HBG1P69891 147 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 HBG2P69892 147 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 NHLH2Q02577 135 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 OR2F1Q13607 317 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 FHL3Q13643 280 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 ZNF345Q14585 488 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 MISP3Q96FF7 219 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 A0A0D9SG52 128 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 BRI3O95415 125 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 CXCL2P19875 107 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 OPRK1P41145 380 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 ZNF616Q08AN1 781 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 ARL16Q0P5N6 197 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 KLK9Q2XQG4 91 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 OR1S2Q8NGQ3 325 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 THYN1Q9P016 225 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 PRSS46E5RG02 174 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 C3orf84H3BNL1 204 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 SAP30O75446 220 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 OR2J3O76001 311 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 IGLV1-40P01703 118 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 TRGV3P03979 118 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-208ENST00000438888 S100A11P31949 105 aa9.56□□□□□ -0.88
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