RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEFB113Q30KQ7 82 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf137Q5JT78 98 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPATA8Q6RVD6 105 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR52R1Q8NGF1 315 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 TOMM6Q96B49 74 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC39A9Q9NUM3 307 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCN3AQ9NY46 2000 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 E9PCH4 1651 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAV3Q8IVL0 2385 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 PEAK1Q9H792 1746 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAV3A0A0B4J244 114 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 NCR3O14931 201 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 SULT1B1O43704 296 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCTN3O75935 186 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2B3O76000 313 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 TCL1BO95988 128 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPL5P46777 297 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS20P60866 119 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC42P60953 191 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPV17LQ2QL34 196 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 C20orf196Q8IYI0 205 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST3H2BBQ8N257 126 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 C3orf56Q8N813 242 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR10J5Q8NHC4 309 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 BORCS5Q969J3 196 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTH2Q96A98 100 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM70Q9BUB7 260 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 RASL12Q9NYN1 266 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERGIC3Q9Y282 383 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 PKIGQ9Y2B9 76 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 HECW1Q76N89 1606 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-227P-201ENST00000362865 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC160A6NGH7 325 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2J2O76002 312 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFNA10P01566 189 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRH1P02810 166 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 CALB1P05937 261 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEFA1P59665 94 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPCS3P61009 180 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2F1Q13607 317 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPRNQ5BIV9 151 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 LPCAT3Q6P1A2 487 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEX261Q6UWH6 196 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKRD29Q8N6D5 301 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSPAN32Q96QS1 320 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 COMMD5Q9GZQ3 224 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 HS3ST2Q9Y278 367 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 U3KQ87 197 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 DOCK5Q9H7D0 1870 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 MTUS2Q5JR59 1369 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 DENND4CQ5VZ89 1909 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 HECW2Q9P2P5 1572 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 DOCK3Q8IZD9 2030 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1W2PPM0 123 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 PROSCO94903 275 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNNC2P02585 160 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPM3P06753 285 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 EFNA4P52798 201 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSME3P61289 254 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIST3H3Q16695 136 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDKL4Q5MAI5 379 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 C8orf74Q6P047 294 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR13D1Q8NGV5 346 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR146Q96CH1 333 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR52E6Q96RD3 313 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 OSTCQ9NRP0 149 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUP155O75694 1391 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP3K5Q99683 1374 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCL25O15444 150 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD79AP11912 226 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPM4P67936 248 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC01554Q52M75 96 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLECL1Q8IZS7 167 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMR3AQ99954 134 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCSTAMPQ9H295 470 aa0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms