RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 MLNRO43193 412 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 SCTP09683 121 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 AHRRA9YTQ3 701 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2H2O95918 312 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 NPSP0C0P6 89 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 GFRA1P56159 465 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 C18orf15Q96N68 181 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 R4GN57 208 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IGKV3-15P01624 115 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 CALYQ9NYX4 217 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFC2O95298 119 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 PLAUP00749 431 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 ADCYAP1P18509 176 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 LHX2P50458 406 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 AGFG2O95081 481 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF415Q09FC8 603 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 CREBBPQ92793 2442 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 ZAR1Q86SH2 424 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM231BA6NCW3 169 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 PDE6HQ13956 83 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5P3Q8WZ94 311 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFA3O95167 84 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 COQ2Q96H96 371 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 C16orf97H3BN30 126 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 REG1BP48304 166 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF815PA8K554 130 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV4-39P01824 125 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 LYPD1Q8N2G4 141 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 ACYP1P07311 99 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 MALP21145 153 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 SFTA2Q6UW10 78 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 PRR33A8MZF0 331 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 RND2P52198 227 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 MST1P26927 711 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TIMP3P35625 211 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 CRYBA2P53672 197 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 SPINK14Q6IE38 97 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 NRTNQ99748 197 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 AMELYQ99218 206 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 THY1P04216 161 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IGKV3-11P04433 115 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 LINC00271P0C7V0 271 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 UNC119Q13432 240 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1W2PPV9 198 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR82Q6UXN9 313 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM126AQ9H061 195 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 LEPROTO15243 131 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 SPINK8P0C7L1 97 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 FGF11Q92914 225 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IFITM1P13164 125 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 EGR1P18146 543 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 C3AR1Q16581 482 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 KLF4O43474 513 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 TNFRSF6BO95407 300 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 CDKN1BP46527 198 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 K7EMI3 77 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-201ENST00000356331 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms