RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 NDUFA3O95167 84 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 C8orf88P0DMB2 117 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 C11orf52Q96A22 123 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 UHRF2Q96PU4 802 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 SLC25A33Q9BSK2 321 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 NBR2O15453 112 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 MOSP00540 346 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 BPIFB3P59826 476 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 SSX2Q16385 188 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM116Q8NCL8 245 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 NDUFS7O75251 213 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 CD99P14209 185 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF343Q6P1L6 599 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 VMO1Q7Z5L0 202 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 OR51G1Q8NGK1 321 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 TRGV9Q99603 122 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 FOXH1O75593 365 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 NDUFB4O95168 129 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 REG1AP05451 166 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 PLGLAQ15195 96 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 MMDQ15546 238 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM37Q8WXS4 190 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD9-201ENST00000249499 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 J3QKU1 62 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 CXCL1P09341 107 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 RPS10P46783 165 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 KLRD1Q13241 179 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 SIRPDQ9H106 197 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 MFAP2P55001 183 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 OR1L6Q8NGR2 347 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 OR2T10Q8NGZ9 312 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 HILPDAQ9Y5L2 63 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 H7BYZ3 331 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 C16orf82Q7Z2V1 217 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 LINC01551Q86U37 167 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF503Q96F45 646 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 MISP3Q96FF7 219 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 COX7A2P2O60397 106 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 IGFBPL1Q8WX77 278 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 FAM210BQ96KR6 192 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 LY96Q9Y6Y9 160 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1W2PRE2 83 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 EBI3Q14213 229 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 C10orf113Q5VZT2 155 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 OR5B12Q96R08 314 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 TNFRSF19Q9NS68 423 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 SCO2A0A1W2PP80 73 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 C5orf52A6NGY3 159 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 FCN1O00602 326 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 PPP1R2P9O14990 202 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 OR7C2O60412 319 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 S100PP25815 95 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 PYGO2Q9BRQ0 406 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 C9JCJ5 164 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 PFN1P07737 140 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 LGALS4P56470 323 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 LMO4P61968 165 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 CNIH1O95406 144 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 AKR1D1P51857 326 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF90Q03938 601 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 OR4X1Q8NH49 305 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 SSX3Q99909 188 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 SLC25A2Q9BXI2 301 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 BPESC1Q9GZL8 116 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 LRRK2Q5S007 2527 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 UBE2CO00762 179 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 SRP14P37108 136 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 PDLIM4P50479 330 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 UBE2E1P51965 193 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 PLP1P60201 277 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 C5orf64Q2M2E5 130 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 Q8N6K4 173 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 STXBP6Q8NFX7 210 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 DERL1Q9BUN8 251 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
HOXD9-201ENST00000249499 LRBAP50851 2863 aa18.21■□□□□ 0.5
HOXD9-201ENST00000249499 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
HOXD9-201ENST00000249499 IMMP2LQ96T52 175 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXD9-201ENST00000249499 TOX4O94842 621 aa18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms