RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.93□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 DNLZQ5SXM8 178 aa14.93□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 OR4X1Q8NH49 305 aa14.93□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.93□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.93□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 TNXAQ16473 311 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 TEX45Q8NA69 505 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 DPM3Q9P2X0 92 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 A0A1W2PN81 502 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 CHRNA7P36544 502 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 GNB1P62873 340 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 GAMTQ14353 236 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 FAM209BQ5JX69 171 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 STPG3Q8N7X2 389 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 NECAP1Q8NC96 275 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 FBXL15Q9H469 300 aa14.92□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 C11orf94C9JXX5 98 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 IGHV3-48P01763 117 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 LMO4P61968 165 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 PAX2Q02962 417 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 PFDN5Q99471 154 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 FABP4P15090 132 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.91□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 LRRK2Q5S007 2527 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 PPP5D1E7EU14 171 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 FCN1O00602 326 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 PDE6DO43924 150 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 AREGP15514 252 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 CD69Q07108 199 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 MMD2Q8IY49 270 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 CFHR4Q92496 578 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 A0A1W2PPV4 95 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 SSX2Q16385 188 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF843Q8N446 348 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 CCL19Q99731 98 aa14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SIKE1-201ENST00000060969 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 FNDC10F2Z333 226 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 ACTL6BO94805 426 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 NPPCP23582 126 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 SIRPDQ9H106 197 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.89□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 ACY3Q96HD9 319 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 LINC00869P0C866 280 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 OR10J1P30954 320 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 LGALS4P56470 323 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 PRR20EP86478 221 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 PRR20CP86479 221 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 PRR20DP86480 221 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 PRR20BP86481 221 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 PRR20AP86496 221 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 MMDQ15546 238 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 F6UZH7 168 aa14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 CEACAM3P40198 252 aa14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 MFAP2P55001 183 aa14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 RAB31Q13636 194 aa14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 PLGLAQ15195 96 aa14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 CST9LP1Q5W188 147 aa14.87□□□□□ -0.03
SIKE1-201ENST00000060969 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.9 ms