RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 BTF3L4Q96K17 158 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 HARBI1Q96MB7 349 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 UHRF2Q96PU4 802 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RNF114Q9Y508 228 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 hADV38S2A0JD32 116 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 EREGO14944 169 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 MT-CO2P00403 227 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 CEP250Q9BV73 2442 aa10.81□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV2-23P01705 113 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 WT1-ASQ06250 92 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 FXYD3Q14802 87 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 PNKDQ8N490 385 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 OR7C2O60412 319 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SERF1AO75920 110 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 IER3P46695 156 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ERVFC1-1P60608 527 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM30BQ3MIR4 351 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RITA1Q96K30 269 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 HELTA6NFD8 242 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf100A8MU93 164 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 FSTL3O95633 263 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ESDP10768 282 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TNFSF4P23510 183 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 GNG4P50150 75 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SELENOVP59797 346 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 IQCJQ1A5X6 159 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RPEL1Q2QD12 228 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM177Q53S58 311 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 CMTM2Q8TAZ6 248 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 CTSZQ9UBR2 303 aa10.8□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 BSPH1Q075Z2 132 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DL5AQ8N109 375 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 C2orf88Q9BSF0 95 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-48P01763 117 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 IRF2P14316 349 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 PATE2Q6UY27 113 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 WFDC8Q8IUA0 241 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF714Q96N38 554 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 NAGKQ9UJ70 344 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ROS1P08922 2347 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ZZEF1O43149 2961 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TDGF1P3P51864 188 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RPL8P62917 257 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TDRG1Q3Y452 100 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00479Q96M42 142 aa10.79□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 PLXNB1O43157 2135 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 NKX6-3A6NJ46 265 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SNURFLB1AK76 121 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SPINK4O60575 86 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SCGB1D1O95968 90 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 CDKN1AP38936 164 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 DLX6P56179 175 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 MS4A10Q96PG2 267 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM178BH3BS89 294 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 DLL1O00548 723 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 FCN1O00602 326 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 PYYP10082 97 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35B1P78383 322 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 NHLRC2Q8NBF2 726 aa10.78□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 INS-IGF2F8WCM5 200 aa10.77□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 C8orf88P0DMB2 117 aa10.77□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa10.77□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM108Q6UXF1 575 aa10.77□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10.77□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.77□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF596Q8TC21 504 aa10.77□□□□□ -0.68
C9orf170-201ENST00000623052 RELNP78509 3460 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 ZGRF1Q86YA3 2104 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 CRYABP02511 175 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 CRISP2P16562 243 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 PPOXP50336 477 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TCL1AP56279 114 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 TAS2R60P59551 318 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 CX3CL1P78423 397 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 DCHS2Q6V1P9 2916 aa10.77□□□□□ -0.69
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PRE2 83 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.9 ms