RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.8■□□□□ 0.28
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CTDP1-208ENST00000613122 TMEM170BQ5T4T1 132 aa16.8■□□□□ 0.28
CTDP1-208ENST00000613122 KCNS1Q96KK3 526 aa16.8■□□□□ 0.28
CTDP1-208ENST00000613122 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa16.8■□□□□ 0.28
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CTDP1-208ENST00000613122 MDS2Q8NDY4 140 aa16.8■□□□□ 0.28
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CTDP1-208ENST00000613122 TRAV41A0A0B4J266 112 aa16.79■□□□□ 0.28
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC25A15Q9Y619 301 aa16.78■□□□□ 0.28
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CTDP1-208ENST00000613122 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
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CTDP1-208ENST00000613122 FBLN5Q9UBX5 448 aa16.75■□□□□ 0.27
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CTDP1-208ENST00000613122 SCGB1A1P11684 91 aa16.75■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 C18orf12Q96KH6 178 aa16.75■□□□□ 0.27
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CTDP1-208ENST00000613122 C3orf36Q3SXR2 165 aa16.75■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 SCGB3A1Q96QR1 104 aa16.75■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
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CTDP1-208ENST00000613122 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
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CTDP1-208ENST00000613122 OR11H1Q8NG94 326 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 OR11H2Q8NH07 326 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 FABP5P3A8MUU1 101 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 ATP5G3P48201 142 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 MINOS1Q5TGZ0 78 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM200BQ69YZ2 307 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 TOMM7Q9P0U1 55 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV1-8P0DP01 117 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 CBLN1P23435 193 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 KLRD1Q13241 179 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF414Q96IQ9 312 aa16.74■□□□□ 0.27
CTDP1-208ENST00000613122 C18orf15Q96N68 181 aa16.74■□□□□ 0.27
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