RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	DEFB135	Q30KP9	77 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	PYDC2	Q56P42	97 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	OR51H1	Q8NH63	302 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFA4	O00483	81 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	OR13C7	P0DN81	318 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	PI3	P19957	117 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TSPAN5	P62079	268 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	MEF2D	Q14814	521 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	BORCS5	Q969J3	196 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM230	Q96A57	120 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	RNF183	Q96D59	192 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468		K7EIM0	57 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468		K7EMT4	169 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	PLA2G10	O15496	165 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	RLN1	P04808	185 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468		P0C879	139 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	IL7	P13232	177 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	F2R	P25116	425 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	ADM	P35318	185 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MUC1-222	ENST00000610468	OR4C46	A6NHA9	309 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	C15orf62	A8K5M9	175 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	RPA2	P15927	270 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	ERVK-16	P61578	105 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	IFITM3	Q01628	133 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	STPG3	Q8N7X2	389 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	S100Z	Q8WXG8	99 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	PPP5C	P53041	499 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	OR5B3	Q8NH48	314 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	GALNT14	Q96FL9	552 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TP53RK	Q96S44	253 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	DISC1	C4P0D8	188 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CTSG	P08311	255 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	LPAR6	P43657	344 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	PIGP	P57054	158 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	OR1P1	Q8NH06	330 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	SEC22A	Q96IW7	307 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	PRRT1	Q99946	306 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	SMPX	Q9UHP9	88 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	PRND	Q9UKY0	176 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	KMT2A	Q03164	3969 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	KRAS	P01116	189 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1-5	P01602	117 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	UCP1	P25874	307 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	DHODH	Q02127	395 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	OR10C1	Q96KK4	312 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	RNF2	Q99496	336 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	NSG2	Q9Y328	171 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0G2JRQ6	117 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	DBX1	A6NMT0	343 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	CHEK1	O14757	476 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77

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