RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 GALMQ96C23 342 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 MUCL1Q96DR8 90 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM8Q96KF7 97 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 GINS3Q9BRX5 216 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OCR1Q9BZK8 76 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TREM1Q9NP99 234 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 PARP11Q9NR21 331 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TENM4Q6N022 2769 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.27□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM218A2RU14 115 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SRRM5B3KS81 715 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 F8W036 122 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-13P01766 116 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 HBZP02008 142 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 CD55P08174 381 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8U9P0C7N5 309 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 PSG2P11465 335 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 GLRXP35754 106 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 LPAR6P43657 344 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFA5Q01523 94 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 PAX5Q02548 391 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 REG3GQ6UW15 175 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZR03 302 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SSX8Q7RTT4 187 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 STX12Q86Y82 276 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SVBPQ8N300 66 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 LFNGQ8NES3 379 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2Z1Q8NG97 314 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8U1Q8NH10 309 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 S100PBPQ96BU1 408 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TBX15Q96SF7 602 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP5SQ99766 215 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2D2Q9H210 308 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ARV1Q9H2C2 271 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.26□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GUS0 222 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 IGSF23A1L1A6 192 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 UMAD1C9J7I0 102 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 C12orf77C9JDV5 145 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 E9PLD3 99 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TOR1AO14656 332 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SYNGR2O43760 224 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SNAPINO95295 136 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNA5P01569 189 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 PRH1P02810 166 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 CFHR2P36980 270 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 CEACAM6P40199 344 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 LEPP41159 167 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 SULT1A1P50225 295 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 DYNLT3P51808 116 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGDIBP52566 201 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 HBG1P69891 147 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 HBG2P69892 147 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 AESQ08117 197 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF616Q08AN1 781 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 BTN1A1Q13410 526 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 CLINT1Q14677 625 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 PEA15Q15121 130 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 RPRMLQ8N4K4 120 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 DRAM1Q8N682 238 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1L1Q8NH94 360 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 UBALD1Q8TB05 177 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR146Q96CH1 333 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2V2Q96R30 315 aa3.25□□□□□ -1.89
CAPNS1-210ENST00000590211 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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