RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ISOC2Q96AB3 205 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 MGST2Q99735 147 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSZQ9UBR2 303 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PPV4 95 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4C13Q8NGP0 309 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 NANPQ8TBE9 248 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 PXMP4Q9Y6I8 212 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 PDE6DO43924 150 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CA2P00918 260 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL3L1P16619 93 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 LYPD2Q6UXB3 125 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 NABP2Q9BQ15 211 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 LYNX1G3V0Z9 82 aa20.52■□□□□ 0.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 YIF1AO95070 293 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 VENTXO95231 258 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 LYNX1P0DP58 116 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM241Q24JQ0 296 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM120AOSQ5T036 256 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10X1Q8NGY0 326 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PN81 502 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 F6UZH7 168 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 TGFAP01135 160 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 STAG3L2P0CL84 134 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 STAG3L3P0CL85 134 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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CAPNS1-204ENST00000587718 RPS16P62249 146 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf24Q9BVV8 132 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 CHODLQ9H9P2 273 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 WASHC3Q9Y3C0 194 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 CXorf1O96002 111 aa20.51■□□□□ 0.87
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CAPNS1-204ENST00000587718 HNF4GQ14541 408 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 ELOBQ15370 118 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM144Q7Z5S9 345 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNG8Q8WXS5 425 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 HARBI1Q96MB7 349 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM7Q9BQ49 75 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 OPN1MWP04001 364 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 OPN1MW2P0DN77 364 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 OPN1MW3P0DN78 364 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PNKDQ8N490 385 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf159Q96HA4 380 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35E1Q96K37 410 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 STAB1Q9NY15 2570 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV1-8P0DP01 117 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 LGALS7P47929 136 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 RHOBP62745 196 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL8P62917 257 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 IL17RELQ6ZVW7 336 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM158Q8WZ71 300 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM133Q9H2Q1 129 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf52A6NGY3 159 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 S100A6P06703 90 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 COL8A2P25067 703 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 ERHP84090 104 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR20EP86478 221 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR20CP86479 221 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR20DP86480 221 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR20BP86481 221 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR20AP86496 221 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00518Q8N0U6 118 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 C8orf46Q8TAG6 207 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 COMMD5Q9GZQ3 224 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 DOCK11Q5JSL3 2073 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 15.5
CAPNS1-204ENST00000587718 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PR64 198 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PRV1 198 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 MT-CO2P00403 227 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 SRD5A1P18405 259 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 B2MP61769 119 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 SSX2Q16385 188 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 FBN3Q75N90 2809 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2CO00762 179 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PAGE4O60829 102 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV2-70P01814 119 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 VMA21Q3ZAQ7 101 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4F5Q8NH21 305 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4F4Q96R69 305 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa20.46■□□□□ 0.87
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