RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-218	ENST00000584243	AREG	P15514	252 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	HOXA5	P20719	270 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CEBPG	P53567	150 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PRCD	Q00LT1	54 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RELB	Q01201	579 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ARL16	Q0P5N6	197 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PDPN	Q86YL7	162 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	LINC00311	Q8N616	119 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TMEM186	Q96B77	213 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	GCM1	Q9NP62	436 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TCF19	Q9Y242	345 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1W2PR64	198 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1W2PRV1	198 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C17orf100	A8MU93	164 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		C9JCJ5	164 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CORT	O00230	105 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	NXPH3	O95157	252 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	IGHV1-46	P01743	117 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	STAG3L2	P0CL84	134 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	STAG3L3	P0CL85	134 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF137P	P52743	207 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SELENOT	P62341	195 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF726P1	Q15940	193 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C2orf83	Q53S99	150 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	S100A7A	Q86SG5	101 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OR4F5	Q8NH21	305 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF596	Q8TC21	504 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		Q8WTZ3	238 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ISOC2	Q96AB3	205 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OR4F4	Q96R69	305 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PFDN5	Q99471	154 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OR51M1	Q9H341	326 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		A0A087X0M5	115 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1B0GV50	99 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243		A0A1B0GX30	115 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SPRY3	O43610	288 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	NDUFB3	O43676	98 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	THBD	P07204	575 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	LGALS7	P47929	136 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	BPIFB3	P59826	476 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	B2M	P61769	119 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	EFNB3	Q15768	340 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ADIRF	Q15847	76 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OR4A47	Q6IF82	309 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ACSM6	Q6P461	480 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	C11orf52	Q96A22	123 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SMIM12	Q96EX1	92 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	ZNF714	Q96N38	554 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	PARL	Q9H300	379 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SLC25A22	Q9H936	323 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	RNF24	Q9Y225	148 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA3-218	ENST00000584243	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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