RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578706.5

UBB-208, Transcript of ubiquitin B, human

TSL 3

Gene UBB, Length 500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBB-208	ENST00000578706	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	RBKS	Q9H477	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706		H3BP45	60 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	FCGR3B	O75015	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	PROP1	O75360	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SNAPIN	O95295	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	HBE1	P02100	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	NQO2	P16083	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	RAB2A	P61019	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SERF2	P84101	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	LTC4S	Q16873	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	S1PR3	Q99500	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.9	□□□□□ -1.62
UBB-208	ENST00000578706	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	AGPAT2	O15120	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HRAS	P01112	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CCL3L1	P16619	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	NFYB	P25208	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF134	P52741	427 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SPCS3	P61009	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	GUK1	Q16774	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	P2RX4	Q99571	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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